法律分析：在合同订立纠纷中，当事人应当明确合同中涉及的知识产权内容，并通过合同约定、技术交底、技术保密协议等措施进行保护。对于违反约定侵犯了自己的知识产权的行为，可以通过起诉、仲裁等方式予以维权。
法律依据：
1.《中华人民共和国合同法》第十二条：当事人订立、履行合同，应当遵循诚实信用原则，遵守公平原则。合同内容应当符合法律、行规的规定，不得违背公序良俗。
2.《中华人民共和国专利法》第五十一条：专利权人或者利害关系人发现他人有侵犯其专利权的行为时，可以请求人民或者专利行政部门处理。
3.《中华人民共和国商标法》第五十五条：对侵犯商标独占权的行为，权利人可以向人民提起诉讼，或者依法向行政部门申请处理。